怎么用Nanodrop 测定双链RNA浓度?
使用Nanodrop光度计测定双链RNA(dsRNA)的浓度是一个简单的过程,但需要正确的方法和适当的对照。
以下是一般步骤:
1.准备工作:
确保样品清洁:确保您的dsRNA样品没有蛋白质或其他污染物,因为这些可能会干扰测量。
使用无RNAase的管和工具:在整个过程中使用无RNAase的管和工具,以避免RNA的降解。
2.Nanodrop操作步骤:
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l 开机并校准Nanodrop:
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l 打开Nanodrop光度计,并确保其已经校准并且温度稳定。
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l 设置测量程序:
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l 在Nanodrop软件中选择“RNA”模式,因为dsRNA的测量与单链RNA类似。
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l 准备标准品(可选,用于构建标准曲线):
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l 如果您有已知浓度的RNA标准品,可以准备一系列稀释液,用于构建标准曲线,以更准确地确定未知样品的浓度。
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l 测量dsRNA样品:
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l 将dsRNA样品稀释(如果必要的话),通常使用无RNAase的水或TE缓冲液。
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l 使用无RNAase的枪头,将稀释后的样品直接滴入Nanodrop的测量槽中。
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l 关闭测量槽盖子,确保没有气泡。
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l 在软件中,选择“Measure”来开始测量。
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l 读取结果:
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l Nanodrop软件会显示吸光度(A)值,特别是260纳米(A260)的吸光度。
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l 记录A260的吸光度值,并检查A260/A280和A260/A230的比值,以评估样品的纯度。
对于dsRNA,理想的A260/A280比值通常在1.8到2.0之间。A260/A230比值应该大于1.5。
3.计算浓度:
如果您没有使用标准曲线,可以使用以下公式计算dsRNA的浓度:
这里的40是一个常数,代表每微克/毫升单链RNA在260纳米的吸光度。对于双链RNA,这个常数可能略有不同,通常在33-37之间,具体取决于dsRNA的碱基组成和结构。建议使用制造商提供的具体数值或通过标准品确定该值。
4.重复测量:
为了确保准确性,可以对每个样品重复测量几次,并计算平均值。
5.注意事项:
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l 确保在测量前将dsRNA样品充分混匀。
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l 避免气泡和样品污染,这些都可能影响测量结果。
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l 如果样品的A260/A280或A260/A230比值不理想,可能需要进一步纯化样品。
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l 使用Nanodrop光度计时,请务必参考设备的操作手册和制造商的建议,以确保获得最准确和可靠的结果。
苏州阿尔法生物提供的
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