小干扰RNA(siRNA)转染细胞是常用的基因沉默技术,以下为相关操作技巧:
一、转染前细胞准备
- 细胞状态:
- 细胞需处于良好生长状态,活力要在90%以上。比如贴壁细胞,转染前刚完成一次传代,处于对数生长期,此时细胞代谢旺盛,摄取外界物质能力强,利于siRNA转染。
- 要避免细胞过度密集或稀疏。细胞过于密集会使营养和空间不足,影响转染效率;过于稀疏则难以检测转染后细胞产生的生物学效应。贴壁细胞汇合度在70 - 80%左右转染较合适。
- 培养基更换:
- 转染前需更换新鲜培养基,因旧培养基成分可能干扰转染试剂和siRNA活性。含高浓度血清的培养基可能与转染试剂结合,降低转染试剂 - siRNA复合物形成效率,一般建议用无血清或低血清培养基转染。
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二、siRNA准备
- 质量检测:
- 确认siRNA的纯度和完整性,可用琼脂糖凝胶电泳检测是否降解,高质量siRNA电泳时应呈现清晰条带,无拖尾现象。
- 测定siRNA浓度,其精确浓度对确定转染试剂用量和转染复合物比例很关键,通常用紫外分光光度计测其在260nm波长处吸光度来计算浓度。
- 设计优化:
- 合理设计siRNA序列,要特异性针对目标基因,避免与其他非靶基因有较高同源性以减少脱靶效应,可借助生物信息学软件辅助设计,设计后最好通过实验验证有效性。
- 对于难转染的细胞或基因,可尝试不同siRNA序列转染,或采用化学修饰的siRNA提高转染效率和稳定性。
三、转染试剂选择与使用
- 选择合适的转染试剂:
- 依细胞类型选转染试剂,不同细胞对其敏感性不同。例如脂质体类适用于多种细胞类型,但对某些原代细胞或难转染细胞,可能需用阳离子聚合物类转染试剂或病毒载体实现高效转染。
- 考虑转染试剂毒性,部分转染试剂可能致细胞死亡或生长异常,选择时需查阅文献或做预实验评估毒性。
- 优化转染试剂 - siRNA复合物的形成:
- 严格按转染试剂说明书制备复合物,一般在无血清缓冲液中混合转染试剂和siRNA,注意混合顺序,通常先加转染试剂入缓冲液轻轻混匀,再加siRNA,然后孵育一段时间让复合物充分形成。
- 优化转染试剂和siRNA的比例,不同组合可能需不同比例达好的转染效果,可设比例梯度实验确定合适用量。
四、转染过程操作
1. -加样方式:
2. - 将转染试剂 - siRNA复合物加入细胞培养孔或培养瓶时,要缓慢滴加,边滴加边轻轻晃动培养容器,使复合物均匀分布,避免局部浓度过高致细胞损伤或转染不均匀。
3. - 对于贴壁细胞,尽量将复合物直接滴加到培养基中,不接触细胞表面,减少对细胞的机械损伤。
4. - 转染时间和温度:
5. - 控制转染时间,不同转染试剂和细胞类型所需转染时间不同,一般转染复合物和细胞孵育时间在4 - 24小时之间,过长孵育时间可能增加转染试剂毒性,过短则转染效率低下。
6. - 注意转染温度,多数转染在37°C进行,但对温度敏感的转染试剂或细胞,可能需在较低温度下转染以提高效率和细胞存活率。
五、转染后处理
1.培养基更换:
- 转染后适时更换培养基,若转染试剂毒性大,转染后4 - 6小时就应换为含血清的完全培养基,减少其对细胞持续伤害,但若换得过早,可能导致转染复合物还未充分发挥作用就被移除,要依实际情况调整。
2. 检测时间点选择:
- 合理选择检测基因沉默效果的时间点,一般转染后24 - 72小时内可检测到目标基因表达下降,但不同基因和细胞类型会有差异,可用实时定量PCR或Western blotting等方法检测基因沉默效果。
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