在生命科学研究领域,Western Blot(蛋白质印迹法)是一种广泛应用的重要实验技术,用于检测特定蛋白质的表达水平。其中,磷酸化蛋白的检测对于研究细胞信号转导等生物学过程具有至关重要的意义。然而,由于磷酸化蛋白的丰度较低且性质特殊,在 Western Blot 操作过程中需要格外注意一些关键问题,以确保实验结果的准确性和可靠性。
一、样品处理阶段
蛋白定量后,应快速将样品与上样缓冲液混合,这一操作的目的在于遏制磷酸酶活性。磷酸酶能够催化磷酸化蛋白去磷酸化,从而改变蛋白的活性状态和功能。如果不及时抑制磷酸酶活性,在样品处理和后续实验过程中,磷酸化蛋白可能会被逐渐去磷酸化,导致实验结果无法准确反映样品中磷酸化蛋白的真实水平。
随后,对于处理后的样本,可以根据实际情况进行选择。一方面,可以将样本等分并储存在低温冰箱中备用,但需要注意的是,样本应避免长期储存,最好现配现用。这是因为随着时间的推移,即使在低温条件下,样品中的蛋白质也可能会发生降解、变性或其他不可预测的变化,尤其是磷酸化蛋白,其稳定性相对较低,长期储存可能会严重影响实验结果。另一方面,如果条件允许,也可以直接加样进行 WB 检测,这样可以最大程度地减少样品变化的风险。
对于磷酸化蛋白的检测,由于其丰度较低,大概只有总蛋白量的 10%,因此在实验时应尽量增加上样量。增加上样量可以提高磷酸化蛋白在凝胶中的浓度,从而增加检测的灵敏度,避免因丰度低而影响实验结果与判断。同时,在处理低丰度蛋白样品时,还应注意操作的轻柔与准确,避免不必要的损失和误差。
二、封闭液的选择
在 Western Blot 实验中,封闭液的作用是封闭膜上未结合蛋白质的位点,以减少非特异性结合,降低背景信号。然而,不同的封闭液对于磷酸化蛋白的检测可能会产生不同的影响。
牛奶中含有大量的一种磷蛋白——酪蛋白。在进行磷酸化蛋白检测时,使用牛奶作为封闭液可能会引起高背景。这是因为酪蛋白与磷酸化蛋白具有一定的相似性,可能会与抗体发生非特异性结合,从而导致背景信号增强,影响实验结果的准确性。
因此,在进行磷酸化蛋白检测时,建议使用牛血清白蛋白(BSA)或无蛋白的封闭剂。BSA 是一种常用的封闭液成分,它具有较低的非特异性结合性,可以有效地封闭膜上的非特异性位点。无蛋白的封闭剂则是专门为磷酸化蛋白检测设计的封闭液,它不含任何蛋白质成分,可以最大程度地减少非特异性结合的风险。
此外,封闭时间也不宜过长,一般 1 - 1.5 小时即可。过长的封闭时间可能会导致封闭过度,同样会增加非特异性结合的风险,影响实验结果。在封闭过程中,应注意保持封闭液的均匀覆盖,避免出现局部未封闭的情况。
三、清洗液的选择与使用
为尽量减少非特异性信号,在 Western Blot 实验中应使用 TBST(Tris Buffered Saline with Tween)代替磷酸盐缓冲液(PBS)。PBS 中含有磷酸钠,而磷酸钠可能会与磷酸化蛋白发生相互作用,增加非特异性结合的风险。TBST 中含有 Tween 等表面活性剂,可以有效地清洗膜上的非特异性结合物,降低背景信号。
如果在中间步骤中必须使用 PBS,则应在加入蛋白检测底物前,用大量 TBST 清洗膜,以除去过量的磷酸钠。这样可以最大程度地减少磷酸钠对实验结果的影响,确保检测的特异性和准确性。
在清洗过程中,应注意清洗的次数和时间。一般来说,清洗次数应根据实验情况进行调整,通常为 3 - 5 次,每次清洗时间为 5 - 10 分钟。清洗时注意保持清洗液的流动,避免出现局部未清洗的情况。
四、特殊磷酸化蛋白的处理
有的磷酸化蛋白会特意注明上样前不要煮沸。这是因为煮沸可能会破坏其磷酸化位点。磷酸化位点是磷酸化蛋白的关键结构,其稳定性相对较低。在高温条件下,如煮沸过程中,磷酸化位点可能会发生变性或水解,从而导致磷酸化蛋白失去其磷酸化状态,影响实验结果。
对于这类特殊的磷酸化蛋白,在样品处理过程中应避免煮沸操作。可以采用其他温和的处理方法,如在较低温度下加热或不进行加热处理。同时,在实验过程中应更加注意操作的温和性,避免对磷酸化蛋白造成不必要的损伤。
在 Western Blot 实验中进行磷酸化蛋白检测时,需要特别注意样品处理、封闭液选择、清洗液使用以及特殊磷酸化蛋白的处理等关键问题。只有严格控制实验条件,注意每一个细节,才能确保实验结果的准确性和可靠性,为生命科学研究提供有力的支持。
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