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技术文章
动植物组织 mRNA 提取方法

  一、实验材料  水稻叶片或小鼠肝组织。 

二、实验室仪器:  研钵,冷冻台式高速离心机,低温冰箱,冷冻真空干燥器,紫外检测仪,电泳仪,电泳槽。

三、实验试剂
 
1 、无 RNA  酶灭菌水:用将高温烘烤的玻璃瓶( 180  2  小时)装蒸馏水,然后加入  0.01% 的 DEPC (体积 /体积),处理过夜后高压灭菌。 

2 75% 乙醇:用  DEPC  处理水配制  75% 乙醇,(用高温灭菌器皿配制),然后装入高温烘烤的玻  璃瓶中,存放于低温冰箱。

3 1 ×层析柱加样缓冲液; 20mmol/L Tris · Cl(pH7.6) 0.5mol/L NaCl 1mmol/L EDTA(pH8.0) 0.1% SDS

4、洗脱缓冲液: 10mmol/L Tris · Cl (pH7.6) 0.05% SDS 。  

  四、动植物总 RNA 提取操作步骤 

(一)动植物总  RNA 提取 -Trizol  法  Trizol  法适用于人类、动物、植物、微生物的组织或培养细菌,样品量从几十毫克至几克。用  Trizol 法提取的总 RNA  绝无蛋白和 DNA  污染。 RNA 可直接用于  Northern  斑点分析,斑点杂交, Poly(A)+  分离,体外翻译,RNase 封阻分析和分子克隆。

1、将组织在液  中磨成粉末后,再以  50-100mg  组织加入  1ml Trizol  液研磨,注意样品总体积  不能超过所用 Trizol 体积的  10%

2、研磨液室温放置  分钟,然后以每  1mlTrizol  液加入  0.2ml  的比例加入氯仿,盖紧离心管,用  手剧烈摇荡离心管 15  秒。 

3 、取上层水相于一新的离心管,按每 mlTrizol  液加 0.5ml  异丙醇的比例加入异丙醇,室温放置  10  分钟, 12000g  离心  10  分钟。

4、弃去上清液,按每  ml Trizol  液加入至少  1ml  的比例加入  75% 乙醇,涡旋混匀, 4 ℃下  7500g  离心  分钟。

5、小心弃去上清液,然后室温或真空干燥  5-10  分钟,注意不要干燥过分,否则会降低  RNA 的  溶解度。然后将  RNA 溶于水中,必要时可  55 -60 ℃水溶  10 分钟。 RNA  可进行 mRNA  分离,或贮 存于 70%乙醇并保存于-70℃。

[注意 ]

 1、整个操作要戴口罩及一次性手套,并尽可能在低温下操作。

2、加氯仿前的匀浆液可在 -70 ℃保存一个月以上, RNA  沉淀在  70% 乙醇中可在  4 ℃保存一周, -20  ℃保存一年。 

(二) mRNA 提取  由于  mRNA  末端含有多  poly(A)+ ,当总  RNA  流径  oligo(dT) 纤维素时,在高盐缓冲液作用下,  mRNA 被特异的吸附在  oligo(dT) 纤维素柱上,在低盐浓度或蒸馏水中,mRNA 可被洗下,经过两次 oligo(dT)  纤维素柱,可得到较纯的  mRNA

  1、用  0.1mol/L NaOH  悬浮  0.5-1.0g oligo(dT) 纤维素。 

2 、将悬浮液装入灭菌的一次性层析柱中或装入填有经 DEPC  处理并经高压灭菌的玻璃棉的巴斯 德吸管中,柱床体积为  0.5-1.0ml,用  倍柱床体积的灭菌水冲洗柱床。

3、用  1x  柱层析加样缓冲液冲洗柱床,直到流出液的  pH 值小于  8.0 。 

4 、将(一)中提取的 RNA  液于 65 ℃温育  分钟后迅速冷却至室温,加入等体积  2x  柱层析缓冲  液,上样,立即用灭菌试管收集洗出液,当所有  RNA 溶液进入柱床后,加入  倍柱床体积的 1x  层析 柱加样溶液。 

5 、测定每一管的 OD260 ,当洗出液中  OD  为  时,加入  2-3  倍柱床体积的灭菌洗脱缓冲液,以 1/3  至 1/2  柱床体积分管收集洗脱液。

6、测定  OD260 ,合并含有  RNA  的洗脱组分。

7、加入  1/10  体积的  3M NaAc(pH5.2)  2.5  倍体积的冰冷乙醇, 混匀,  -20 30  分钟。

8 4 ℃下  12000g  离心  15  分钟,小心弃去上清液,用  70% 乙醇洗 涤沉淀, 4 ℃下  12000g  离心  分钟。

9、小心弃去上清液,沉淀空气干燥  10 分钟,或真空干燥  10  分钟。

10、用少量水溶解  RNA  液,即可用于  cDNA  合成(或保存在  70% 乙醇中并贮存于 -70 ℃)。

当然,如果使用天根或碧云天的动植物组织 mRNA 提取试剂盒也会省去很多步骤,节约实验耗材成本。

[注意 ]

‍ 1 mRNA 在  70% 乙醇中 -70 ℃可保存一年以上。

2 oligo(dT) 纤维素柱用后可用  0.3mol/l NaOH  洗净,然后用层析柱加样缓冲液平衡,并加入  0.02% 叠氮钠(NaN3) 冰箱保存,重复使用。每次用前需用 NaOH  水层析柱加样缓冲液依次淋洗柱床。