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pcr标准操作流程
来源: 生物实验器材 时间:2024-08-09

PCR标准操作流程详解

一、概述

聚合酶链式反应(Polymerase Chain Reaction,简称PCR)是一种在体外合成双链DNA的技术。其原理模仿了天然DNA的复制过程,通过特异引物和高特异性酶,确保反应的特异性。典型的PCR反应包括三个步骤:变性、退火和延伸,通过多次循环,最终获得目标DNA片段。


A300

二、试剂准备

以下为进行PCR反应所需的试剂及其终浓度:

试剂 终浓度

PCR buffer 1x

dNTPs <0.4mM

Forward primer <0.4uM

Reverse primer <0.4uM

Template DNA <100ng

热启动酶 5U

ddH2O Up to 50 ul

三、操作步骤

1. 配置反应体系

将以下成分按顺序加入0.5ml的离心管中:

加入PCR buffer

加入dNTPs

加入Forward primer

加入Reverse primer

加入Template DNA

l 加入热启动酶。

ddH2O补至总体积50 ul

注意:使用热启动酶时,可在常温下操作;非热启动型酶需在低温下配置反应体系。 

2. 设置反应条件

根据试剂盒说明书设置反应时间和温度,完成扩增后进行电泳鉴定。

天能水平电泳槽

3. 琼脂糖核酸电泳

① 准备电泳器具,用蒸馏水洗净并架好梳子。

根据所需分离的DNA片段大小,制备适当浓度的琼脂糖凝胶。

将琼脂糖和电泳缓冲液(TAETBE)加入锥形瓶中,加热融化后冷却至40℃左右,混匀并倒入电泳槽。

④ 室温下凝固凝胶,拔出梳子,准备点样。

⑤ 在电泳槽中加入电泳缓冲液,确保覆盖凝胶表面。

混合5ul样品、1ul6xLoding buffer1ul染料,缓缓注入点样孔,避免串孔。

接通电源(红正黑负),设置电压40-60V,电泳时间30-40min,根据溴酚蓝的位置判断是否终止电泳。

电泳结束后,关闭电源,进行凝胶成像观察,并对比marker确定片段大小。

不同琼脂糖浓度对应的DNA片段大小如下表:

琼脂糖浓度/% DNA 大小 /kb

0.3 5-60

0.5 1-30

0.7 0.8-12

1.0 0.5-10

1.2 0.4-7

1.5 0.2-3

2.0 0.05-2

四、注意事项

引物设计

Ø 引物应设计在cDNA的保守区域。

Ø 引物长度应在15-28bp之间。

Ø GC含量应在40%-60%之间。

Ø 避免引物自身形成发夹结构,完成后进行BLAST验证。

pcr实验步骤

模板DNA

Ø 模板可以是单链或双链DNA。

Ø 不同来源的模板起始浓度有一定要求。

Ø 模板提取后应注意保存,避免降解。

其他

Ø 选择合适的Taq DNA聚合酶。

Ø 确保四种dNTP浓度相同。

Ø 操作过程中戴手套,保持环境干净,防止污染。

Ø PCR用水需经过高压灭菌或0.2um滤膜过滤。

五、常用试剂配方

电泳缓冲液

50xTAEpH8.5

Tris 242g

EDTANa37.2g

Ø 加入800ml去离子水,搅拌溶解

Ø 加入57.1ml乙酸,调pH8.5后定容至1L

10xTBEpH8.3

Tris 108g

EDTA 7.44g

硼酸55g

Ø 加入800ml去离子水,搅拌溶解,调pH8.3后定容至1L

上样缓冲液(6xLoding buffer

0.25%二甲苯青

0.25%溴酚蓝

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