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昆虫细胞质粒DNA提取和酶切的完整实验步骤
来源: 时间:2023-09-14

昆虫细胞质粒DNA提取和酶切是一种常用的实验方法,用于研究昆虫基因组和基因功能。昆虫细胞需要被裂解,释放DNA。接着,使用DNA提取试剂盒提取DNA,纯化得到目标DNA。然后,通过酶切反应使用限制性内切酶对DNA进行切割。这些步骤将可用于进一步的实验,如PCR扩增和DNA测序,以研究昆虫基因的结构和功能。

一、昆虫细胞质粒DNA提取

实验材料:

- 1.5ml细菌培养物

- 100 μl溶液I50 mmol/L葡萄糖,10 mmol/L EDTA pH 8.025 mmol/L Tris-HCl pH 8.0

- 200 μl溶液II0.2 mol/L NaOH1SDS

- 150 μl溶液III60 ml 5 mol/L乙酸钾,11.5 ml 冰乙酸,28.5 ml H2O

- 70%乙醇

- ddH2O

- 0.5μl RNase

-质粒提取试剂盒

步骤:

1. 1.5ml细菌培养物,4000rpm离心1分钟,弃上清液,使细菌沉淀尽量干燥。

2. 将细菌沉淀重悬于用冰预冷的100 μl溶液I中,剧烈振荡。

3. 加入200 μl溶液II,盖紧管口,快速颠倒离心管5次,使溶液II与细菌完全混合,置于冰浴中。

4. 加入150 μl溶液III,盖紧管口,反复颠倒数次,使溶液III在细菌裂解物中均匀分散,置于冰上3-5分钟。

5. 在最大转速下离心5分钟,取上清液于另一个新的管中。

6. 用两倍体积的乙醇沉淀DNA,振荡混合,室温放置2分钟,最大转速离心5分钟。

7. 小心吸去上清液,倒置于滤纸上,使所有液体都流出。

8. 加入1ml 70%乙醇洗涤沉淀,振荡混合,用12000g离心2分钟,弃上清液,放置于室温使乙醇挥发,直至EP管内没有可见液体存在(5-10分钟)。

9. 0.5μlRNase37℃温育5-10分钟。

10. 使用电泳仪设备进行琼脂糖电泳鉴定。

二、昆虫细胞质粒DNA酶切

实验材料:

- 待切样品DNA

- 10×缓冲液

- 限制性内切酶

- ddH2O

步骤:

1. 酶切前确定待切样品的浓度,并选择合适的限制性内切酶和配套缓冲液。

2. 在离心管中加入如下成分:10×缓冲液1μl、待切样品xμl、酶0.5-1μl,加水补足10μl

3. 混匀样品并短暂离心使样品沉于管底。

4. 将离心管置于37℃中温育1-3小时,若待切样品为PCR产物,则可延长反应时间。

5. 用未酶切的质粒作为对照,进行琼脂糖电泳鉴定酶切结果。

三、昆虫细胞质粒DNA连接

实验材料:

- 待连接的样品(胶回收产物或PCR产物,载体与片段的mol比为13-5

- 10×连接缓冲液

- T4连接酶

- ddH2O

步骤:

1. 连接前先使用电泳仪确定待连接载体与片段的浓度。

2. 在离心管中加入如下成分:10×连接缓冲液1μl、待连接的样品xμl、连接酶0.5-1μl,加水补足10μl

3. 混匀样品并短暂离心使样品全部沉于管底。

4. 将离心管置于连接酶要求的温度孵育适当的时间(根据不同公司的酶的要求而定,一般为221-3小时或16℃连接过夜)。

5. 连接完的样品可直接用于转化,也可放于4℃冰箱短期保存。

通过以上实验步骤,可以实现昆虫细胞质粒DNA的提取、酶切和连接,为后续的PCR扩增等实验

四、PCR扩增

实验材料:

- 连接完的样品

- PCR反应体系所需试剂(Taq聚合酶、引物、反应缓冲液等)

- ddH2O

-PCR仪

步骤:

1. 准备PCR反应体系,根据实验需要确定反应体系组份和体积,同时设计合适的引物。

2. PCR反应管中加入反应体系所需试剂,如Taq聚合酶、引物和反应缓冲液等。

3. 加入连接完的样品,注意控制反应体系中DNA的浓度。

4. 加入适量的ddH2O补足反应体系总体积。

5. 进行PCR扩增反应,根据引物设计的温度条件选择合适的PCR程序。

6. 扩增结束后,取10μl反应产物进行琼脂糖电泳分析,确认PCR扩增结果。

五、DNA回收与纯化

实验材料:

- PCR反应产物

- 天根DNA回收试剂盒(如PCR纯化试剂盒)

步骤:

1. 准备天根DNA回收试剂盒,根据试剂盒说明书中的步骤进行操作。

2. PCR反应产物加入DNA回收试剂盒提供的柱子或管子中,进行离心分离。

3. 紧接着,根据试剂盒的要求,采用洗涤缓冲液进行洗涤步骤,去除杂质。

4. 使用洗涤缓冲液洗涤后,将柱子或管子中的DNA进行洗脱,得到纯化后的DNA样品。

5. 使用琼脂糖电泳仪鉴定纯化后的DNA样品的质量和浓度。

通过以上实验步骤,你可以将昆虫细胞质粒DNA经过PCR扩增,然后进行DNA回收与纯化,得到纯净的DNA样品,用于后续的分析、测序等实验。

实验总结:

这个实验步骤详细介绍了昆虫细胞质粒DNA的提取、酶切、连接、PCR扩增以及DNA回收与纯化的过程。这些步骤需要仔细操作,以确保提取的DNA质量和纯度。此方法适用于小量质粒DNA的提取,提取的质粒DNA可直接用于酶切和PCR扩增。在实验过程中,注意控制反应条件,如时间、温度和试剂浓度,以确保实验结果的准确性。然后使用天能琼脂糖电泳进行分析,以确认提取的DNA的质量和浓度。

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